يتمتع مسجد المصطفى – صلى الله عليه وسلم – برعاية كاملة من قبل الهيئة العامة للعناية بشؤون المسجد النبوي، حيث يتلقى اهتماماً دؤوباً على مدار الساعة. يتضمن ذلك عمليات التطهير والتعطير المستمرة للمسجد، حيث يتم غسل أرضياته وساحاته وسطحه خمس مرات يومياً، وتعطيره بأجود أنواع الورد المديني.
تشمل جهود الرعاية أيضاً تنظيف وتعقيم 25000 سجادة يومياً، فضلاً عن تعقيم وتطهير مرافق المسجد ودورات المياه بنفس العدد من المرات يومياً. كما تتبع الهيئة برنامجاً خاصاً لصيانة مظلات وفتحات التكييف والجدران بعناية فائقة طوال الوقت.
يُظهر ذلك التفاني والاهتمام الذي توليه الهيئة للحفاظ على نظافة ونقاء هذا المكان المقدس، والذي يشهد زيارة الكثير من المصلين والزوار يومياً.
