اللجان المتخصصة في مجلس الشورى تمثل العمود الفقري للمجلس، حيث تدرس الموضوعات والأنظمة ذات العلاقة التي تحال إليها، وتقدم تقارير تتضمن آرائها وتوصياتها. يتكون المجلس من خمسة عشر لجنة متخصصة، تشمل لجان الشؤون الإسلامية، التجارة، والطاقة، بالإضافة إلى لجان الصحة، التعليم، وحقوق الإنسان، وغيرها.
تعتمد اللجان منهجاً علمياً في دراستها، مع التركيز على الصالح العام، وتقوم بجمع آراء أعضائها بصرف النظر عن انتمائهم للجنة المعنية. يُدعى أعضاء المجلس للاجتماع من قبل رؤساء اللجان، وتصدر التوصيات بناءً على أغلبية الأصوات.
خلال دورة المجلس الثامنة، ناقشت اللجان 645 تقريراً لأداء الأجهزة الحكومية ودرست 92 مقترحاً و267 نظاماً ولائحة. وقد بلغ عدد اجتماعاتها 1173 اجتماعاً بحضور 1502 مسؤول حكومي. في السنة الرابعة من هذه الدورة، أنجزت اللجان 177 تقريراً، و20 مقترحاً، و57 نظاماً، و225 اتفاقية، مما يعكس دورها الفعال في صناعة القرار الشوري وضمان دقة القرارات المتخذة.
